Interface da Base de Dados PubMed (Curso Bsico: Mdulo 4)

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    07-Apr-2016

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  • Interface da Base de Dados PubMed(Curso Bsico: Mdulo 4)

  • Sumrio

    Abrir a PubMedNavegar na PubMedSeleccionar uma base de dados onde pesquisar na barra preta da base de dadosPesquisar na PubMedOpes de visualizaoOpes para imprimir, salvar/guardar e enviar por e-mail (correio electrnico)

  • Antes de fazer o login nos websites dos servios das Editoras Parceiras (Partner Publisher services), vamos fazer Login no site do HINARI usando a URL (endereo de Internet) http://www.who.int/hinari/

  • Precisamos de inserir o nosso Nome de Utilizador (User Name) e Senha (Password) do HINARI nas caixas apropriadas e clicar no boto de Login (Sign In na imagem). Para ter acesso aos textos completos dos artigos deve-se fazer o Sign In adequadamente.Desde a migrao para um novo servidor de autenticao (Jan. 2014), recomenda-se o uso dos browsers Chrome ou Mozilla. Se usa o Internet Explorer, ter que fazer login duas vezes.

  • Se usa o Browser Internet Explorer, repita o processo de Login (Sign In) e nesta segunda pgina voc ser redireccionado para a Pgina de Contedos (Contents page) do HINARI.

  • Uma vez feito o login (Sign In) na Pgina de Contedos (Content page) do HINARI, aceda PubMed clicando em Search inside HINARI full-text using PubMed.

  • Lembre-se de aceder PubMed atravs do HINARI, seno no ter acesso aos textos completos dos artigos.

  • A caixa de pesquisa (Search box) na PubMed est activa. Escreva a sua expresso de pesquisa.Neste exemplo, a expresso de pesquisa escrita na caixa malaria infections AND africa. Para executar a busca, clique no boto Search.

  • Os resultados da busca so exibidos no corpo principal da pgina, no formato de referncia bibliogrfica (Summary Format), apresentando 20 resultados por pgina e Ordenados pelo Mais Recente. Este o formato de exibio por defeito quando se completa a busca. Note os dois filtros adicionais para textos completos em Acesso Livre (Free Full Text) e artigos extrados do Portal do HINARI. Estes dois filtros adicionais foram criados para as buscas no HINARI/PubMed.Dos 5483 artigos, 2499 esto disponveis por via do filtro do HINARI e 2645 com o filtro Texto Completo em Acesso Livre (Free full text) (havendo algumas sobreposies).

  • Note a utilidade das opes na coluna direita dos resultados da busca na PubMed:Ordenados por Relevncia (uma nova opo, criada em Outubro de 2013)Grfico de Resultados por Ano/DataListagem de Ttulos com os seus Termos de PesquisaArtigos em Texto Completo e Acesso Livre na PubMed Central (repositrio do Instituto Nacional de Sade dos EUA)Veja no prximo slide a caixa de detalhes da busca (Search details).

  • Esto destacados os detalhes da busca (Search details) que incluem todos os campos (all fields) onde se inseriram palavras-chave para malria, infeco, infeces e africa E( AND) Termos MeSH (Cabealhos Mdicos por Assunto) para malria, infeco e africa. Os Termos MeSH so criados por indexadores da Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA . Para mais informao veja o Curso Avanado Mdulo 1.

  • Note no link adicional de hipertexto para Artigo em Acesso Livre ( Free Article) e Artigo PMC em Acesso Livre (Free PMC Article). Ao clicar neste link, voc ser redireccionado para a exibio do Abstract (Resumo) e poder ter acesso ao texto completo.Veja ainda os termos em negrito da busca malaria, infections e Africa.

  • Se voc clica nos hyperlinks do Artigo em Acesso Livre (Free Article) ou do artigo PMC em Acesso Livre ( Free PMC Article), voc redireccionado para o Formato Abstract (Resumo).Clique em links de Texto Completo ( Full text links) para aceder ao website da Editora e ao texto completo do artigo.

  • Aqui voc pode ver o acesso ao texto completo do arigo de uma revista cientfica da BioMed Central.

  • Agora vamos verificar o bullet do Formato Abstract (Resumo) no menu drop down (seta para baixo). Retivemos as opes dos 20 resultados por pgina e Ordenao pelo Mais Recente.

  • Note que as opes do Formato Abstract (Resumo) com 20 resultados por pgina e Ordenados pelo Mais Recente so exibidas na linha Configurao de Exibio (Display Settings) acima do abstract (resumo).Note os Filtros Free Full Text (Texto Completo em Acesso Livre) e HINARI. Usar estas opes depende das suas preferncias.

  • Depois de clicar no Formato Abstract (Resumo), aparece a lista de todos os artigos, incluindo os cons do HINARI e da Editora e/ou do Texto Completo em Acesso Livre. Ao clicar no con HINARI ou Editora, o texto completo do artigo ser exibido. Note que alguns artigos tero ambos os cones HINARI e Texto Completo em Acesso Livre (Free Full Text) no Formato Abstract (Resumo).

  • Em Agosto de 2010, a PubMed melhorou a exibio do Abstract (Resumo). Nos resumos estruturados (structured abstracts), os cabealhos principais (INTRODUO/BACKGROUND, MTODOS E RESULTADOS e/ou, CONCLUSES e PALAVRAS-CHAVE) esto listados no incio de cada pargrafo. Aproximadamente 20% das citaes na PubMed usam este formato.

  • Por baixo de cada citao, existe a opo Artigos Similares/Semelhantes (Similar articles). O resultado desta busca inclui 101 artigos, sendo 56 em Texto Completo em Acesso Livre (Free Full Text) e 38 no HINARI.

    **Todos os mdulos HINARI/PubMed iro enfatizar as habilidades necessrias para usar a PubMed como uma ferramenta para identificar e aceder a artigos em texto completo. A PubMed uma das maiores Bases de Dados na rea Biomdica que indexa mais de 5,500 revistas cientficas biomdicas. As habilidades nestes mdulos incluem uma viso geral do website (pgina de Internet) da PubMed, o uso de filtros na PubMed, Medical Subject Headings (MESH) (Cabealhos Mdicos Indexados) e outras ferramentas (preview/index, filtros e histrico) para estratgias de busca e usando o MY NCBI,uma plataforma que lhe permite activar caixas de filtros na sua rea de exibio, salvar/graver as suas buscas e receber e-mail de alerta para novos artigos adicionados PubMed. Ao apreder estas habilidades, voc vai adquirir um domnio valioso para a utilizao as revistas cientficas electrnicas(e-journals) que esto disponveis via HINARI especialmente porque voc ser capaz de identificar artigos disponveis de mltiplas revistas cientficas e das Editoras associadas ao HINARI. Tal como no primeiro modulo, voc precisa de ter acesso Internet e ser-lhe- solicitado/a resolver uma srie de exercios. Voc dever fazer login no HINARI e ir para Search inside HINARI full-text using PubMed (Busca no HINARI por Textos Comletos usando a PubMed) seno no ter acesso aos artigos em texto completo. **No Portal do HINARI voc pode ter acessp PubMed a partir da Pgina de Contedos (Content page). Clique em Search inside HINARI full-text using PubMed.Nota voc pode abrir directamente o Portal da PubMed, mas, se no aceder a partir do HINARI, voc no ter os links para os textos completos dos artigos para as quais as Editoras ofereceram acesso sua instituio atravs do HINARI. Abrindo directamente o Portal da PubMed, voc ter poder apenas usar os artigos em acesso livre. *Algumas pessoas preferem ver os resultados da busca numa mistura de formatos, HINARI e artigos em texto completo em Acesso Livre e outras preferem usar os filtros.

    *Dependendo da sua preferencia, algunas das opes na coluna direita podem ser bastante teis para si.*Veja como a busca na PubMed combina palavras-chave com os Cabealhos Mdicos por Assunto (Medical Subject Headings - MeSH) que so estabelecidos por indexadores da Biblioteca Nacional de Medicina dos EUA (National Library of Medicine - USA).*Se voc conclui uma busca na PubMed regular, este(s) artigo(s) em Acesso Livre e Artigo(s) PMC em Acesso Livre estaro nos seus resultados da busca, mas no nos resultados do HINARI. Lembre-se que h alguma ssobreposies.**O uso da exibio do Abstract (Resumo) (Abstract display) importante por duas razes voc pode ler o abstract (resumo) para confirmer se o artigo um artigo que voc quer ler e se o formato de exibio tem links para os textos completos dos artigos em acesso livre e para o HINARI artigos em texto completo a ser discutido nas notas do prximo slide.

    *Este aspecto fundamental. O format Abstract (Resumo) contm os cons/links para o texto completo. Este programa da PubMed chamado Linkout porque estabelece os links com os artigos em texto completo que voc pode aceder seja como artigos em texto completo e de acesso livre ou os artigos disponveis atravs do HINARI. Note the Linkout program does not work 100% of the time. If the HINARI icon does not work properly, click on the link to the publisher. If neither work, you will need to return to the HINARI Content page and try to access the journal article through the Journal Collection A-Z list or Publishers list. Access Problems and Solutions are discussed in the Basic Course Module 3 Appendix in a presentation with that title. *Este formato bastante til pelo facto de mostrar claramente o contedo do artigo.*A opo Similar Articles (Artigos Semelhantes) d-lhe acesso a citaes e possivelmente textos completos de artigos semelhantes citao original.*